Erki ja Maido tutvustasid uut artiklit Vikerraadio saates LABOR ja ERR portaalis Novaator.

Aun jt. publitseerisid artikli ajakirjas PLoS Computational Biology.

Erki esimene artikkel bakterigenoomidest resistentsusgeenide otsimisest on saadetud ajakirjale PLoS Computational Biology. Käsikiri on üleval biorXiv‘is.

Triinu, Maarja ja teiste kaasautorite pikaajalise töö tulemusena valminud genoomide maskeerija (primer3_masker) artikkel ilmus lõplikul kujul ajakirjas Bioinformatics. Kood saadaval GitHub‘is.

Ajakirjas Frontiers in Plant Science ilmus aasta alguses Maido Remmi ja Kairi Raime artikkel “Method for the Identification of Taxon-Specific k-mers from Chloroplast Genome: A Case Study on Tomato Plant (Solanum lycopersicum)”.

In June an article titled“StrainSeeker: fast identification of bacterial strains from raw sequencing reads using user-provided guide trees” was published in PeerJ by Märt Roosaare, Mihkel Vaher, Lauris Kaplinski, Märt Möls, Reidar Andreson, Maarja Lepamets, Triinu Kõressaar, Paul Naaber, Siiri Kõljalg ja Maido Remm.
Link artiklile

In May there was an article published by Fanny-Dhelia Pajuste, Lauris Kalpinski, Märt Möls, Tarmo Puurand, Maarja Lepamets ja Maido Remm in Scientific Reports, titled “FastGT: an alignment-free method for calling common SNVs directly from raw sequencing reads”.
Link artiklile

2015. aasta detsembris ilmus ajakirjas GigaScience artikkel “GenomeTester4: a toolkit for performing basic set operations – union, intersection and complement on k-mer lists”, autoriteks Lauris Kaplinski, Maarja Lepamets ja Maido Remm.

Link artiklile

Andmebaasi ISI Web of Knowledge andmetel on bioinformaatika õppetooli teadur Triinu Kõressaar 2015. aasta detsembrist alates arvutiteaduste valdkonnas maailma 1% enim viidatud teadlaste hulgas.

Rahvusvaheline komisjon hindas Eesti info- ja kommunikatsioonitehnoloogia alast teadus- ja arendustegevust perioodil 2009-2014. Sihtevalveerimisel osales ka Tartu Ülikool.

Eesti IKT valdkond sai kõrge hinnangu ning TÜ MRI bioinformaatika töögrupi teaduslikku taset hinnati hindega “excellent”.

Pressiteade

Raport

Evalveerimisest

Teadusajakiri PLoS One avaldas hiljuti artikli “Haplotype Phasing and Inheritance of Copy Number Variants in Nuclear Families” Priit Palta ja Lauris Kaplinski loodud algoritmist, mis leiab kajastust nüüd ka veebilehel Novaator.