Category Archives: Uudised
Kairi küpsised meedias
Kairi artikli kajastus TÜ kodulehel, Novaatoris ja Postimehes.
Kairi artikkel küpsiste sekveneerimisest on vastu võetud
Ajakirjas Frontiers in Plant Science ilmus mais 2020 Kairi Raime artikkel “Method for the identification of plant DNA in food using alignment-free analysis of sequencing reads: a case study on lupin”.
Tarmo artikkel ajakirjas Mobile DNA
Juulis ilmus Tarmo pikaajalise töö viljana artikkel Alu elementide otsimise meetodist AluMine. Töö avaldati ajakirjas Mobile DNA.
Teaduse populariseerimine
PhenotypeSeeker
Aun jt. publitseerisid artikli ajakirjas PLoS Computational Biology.
Erki artikkel biorXiv’is väljas
Erki esimene artikkel bakterigenoomidest resistentsusgeenide otsimisest on saadetud ajakirjale PLoS Computational Biology. Käsikiri on üleval biorXiv‘is.
Ilmus artikkel ajakirjas Bioinformatics
Triinu, Maarja ja teiste kaasautorite pikaajalise töö tulemusena valminud genoomide maskeerija (primer3_masker) artikkel ilmus lõplikul kujul ajakirjas Bioinformatics. Kood saadaval GitHub‘is.
Ilmus artikkel ajakirjas Frontiers in Plant Science
Ilmusid artiklid ajakirjades PeerJ ja Scientific Reports
In June an article titled“StrainSeeker: fast identification of bacterial strains from raw sequencing reads using user-provided guide trees” was published in PeerJ by Märt Roosaare, Mihkel Vaher, Lauris Kaplinski, Märt Möls, Reidar Andreson, Maarja Lepamets, Triinu Kõressaar, Paul Naaber, Siiri Kõljalg ja Maido Remm.
Link artiklile
In May there was an article published by Fanny-Dhelia Pajuste, Lauris Kalpinski, Märt Möls, Tarmo Puurand, Maarja Lepamets ja Maido Remm in Scientific Reports, titled “FastGT: an alignment-free method for calling common SNVs directly from raw sequencing reads”.
Link artiklile