BI seminaride kava 2020

Kairi artikli kajastus TÜ kodulehel, Novaatoris ja Postimehes.

Ajakirjas Frontiers in Plant Science ilmus mais 2020 Kairi Raime artikkel “Method for the identification of plant DNA in food using alignment-free analysis of sequencing reads: a case study on lupin”.

Link artiklile

Juulis ilmus Tarmo pikaajalise töö viljana artikkel Alu elementide otsimise meetodist AluMine. Töö avaldati ajakirjas Mobile DNA.

Erki ja Maido tutvustasid uut artiklit Vikerraadio saates LABOR ja ERR portaalis Novaator.

Aun jt. publitseerisid artikli ajakirjas PLoS Computational Biology.

Erki esimene artikkel bakterigenoomidest resistentsusgeenide otsimisest on saadetud ajakirjale PLoS Computational Biology. Käsikiri on üleval biorXiv‘is.

Triinu, Maarja ja teiste kaasautorite pikaajalise töö tulemusena valminud genoomide maskeerija (primer3_masker) artikkel ilmus lõplikul kujul ajakirjas Bioinformatics. Kood saadaval GitHub‘is.

Ajakirjas Frontiers in Plant Science ilmus aasta alguses Maido Remmi ja Kairi Raime artikkel “Method for the Identification of Taxon-Specific k-mers from Chloroplast Genome: A Case Study on Tomato Plant (Solanum lycopersicum)”.

In June an article titled“StrainSeeker: fast identification of bacterial strains from raw sequencing reads using user-provided guide trees” was published in PeerJ by Märt Roosaare, Mihkel Vaher, Lauris Kaplinski, Märt Möls, Reidar Andreson, Maarja Lepamets, Triinu Kõressaar, Paul Naaber, Siiri Kõljalg ja Maido Remm.
Link artiklile

In May there was an article published by Fanny-Dhelia Pajuste, Lauris Kalpinski, Märt Möls, Tarmo Puurand, Maarja Lepamets ja Maido Remm in Scientific Reports, titled “FastGT: an alignment-free method for calling common SNVs directly from raw sequencing reads”.
Link artiklile