Selle aasta instituudi aastakonverentsi korraldab meie õppetooli korraldustoimkond koosseisus Reidar Andreson, Age Brauer, Fanny-Dhelia Pajuste, Tarmo Puurand, Karita Helde ja Maido Remm
Author Archives: maido
Fanny geenide koopia arvu leidmise metoodika publitseeritud!
GeneToCN: an alignment-free method for gene copy number estimation directly from next-generation sequencing reads
Pajuste FD, Remm M.
The paper was published in Scientific Reports (Nature group journal)
https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/37853040/
Katvuse määramise programmi DOCEST kirjeldav artikkel on avaldatud
https://academic.oup.com/bioinformaticsadvances/article/3/1/vbad084/7225878
DOCEST—fast and accurate estimator of human NGS sequencing depth and error rate
Laurise artikkel vastu võetud!
Laurise esimese autori artikkel: “KATK: fast genotyping of rare variants directly from unmapped sequencing reads” on läbinud peer review ja vastu võetud ajakirjas Human Mutation. Tänud Laurisele ja kõigile kaasautoritele suure töö eest artikli ettevalmistamisel.
https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.12.23.424124v1
Erki artikkel vastu võetud
Erki esimese autori artikkel “Molecular characterization of Enterococcus isolates from different sources in Estonia reveals transmission of resistance genes” on vastu võetud ajakirjas Frontiers in Microbiology.
Seminaride kava 2020
Kairi küpsised meedias
Kairi artikli kajastus TÜ kodulehel, Novaatoris ja Postimehes.
Kairi artikkel küpsiste sekveneerimisest on vastu võetud
Ajakirjas Frontiers in Plant Science ilmus mais 2020 Kairi Raime artikkel “Method for the identification of plant DNA in food using alignment-free analysis of sequencing reads: a case study on lupin”.
Tarmo artikkel ajakirjas Mobile DNA
Juulis ilmus Tarmo pikaajalise töö viljana artikkel Alu elementide otsimise meetodist AluMine. Töö avaldati ajakirjas Mobile DNA.