LÕPUTÖÖ TEEMAD ÜLIÕPILATELE
Bioinformaatika uurimisgrupis on üliõpilastel võimalik teadustöös osaleda mitmesugustes erinevates projektides erinevatel tasemetel (3+2 lõputööd, magistriõpe, doktoriõpe).
Töö on peamiselt arvutuslik, laboriandmeid saame üljuhul koostöös teiste töögruppidega.
Meie üldine eesmärk on arendada arvutusalgoritme genoomijärjestuste usaldusväärseks ja kiireks analüüsiks.
Mõned näited:
* antimikroobse resistentsuse ennustamine ja plasmiidide tuvastamine bakteri genoomse DNA järjestusest;
* mikroobsete patogeenide DNA tuvastamine inimese verest (rakuvaba DNA fraktsioonist) või muudest allikatest;
* toidupatogeenide ja roiskumisega seotud mikroobide tuvastamine ja päritolu määramine metagenoomse DNA järjestamisel.
* toidu koostise ja päritolu määramine toidus leiduva DNA abil.
Üldiseks eelduseks on sõbralik suhe programmeerimise ja/või Linuxiga.
Huvi korral pöörduge vastava projekti läbiviija või uurimisgrupi juhi (prof. Maido Remm) poole.