Erialaste terminite eestindused

Käesoleval lehel on meie õppetooli poolt väljapakutud eestikeelsed vasted erialastele terminitele. Soovituste või täienduste korral kirjutage palun: maido.remm@ut.ee

  • read – lugem
  • contig – pidevjärjestus, kontiig, ühendlugem
  • scaffold – raamjärjestus, ühendjärjestus
  • assembly – ühendatud genoom, kokkupandud genoom
  • chaff contigs – rämpslugemid
  • fragment (single-end) reads – üksiklugemid
  • paired end reads* – paarislugemid
  • mate pair reads*  – paarislugemid
  • to map – paigutama
  • to assemble (de novo) – ühendama, kokku panema
  • to trim reads – lugemeid kärpima
  • shell – käsurea töökeskkond, tekstiterminal, kest
  • script – skript
  • scripting language – skriptimiskeel
  • pipe (tekstiterminalis) – toru
  • pipeline (tekstiterminalis) – käsuahel
  • pipeline (omaette programmihaldus tarkvarana) – tarkvara, tarkvara konveier, tarkvara tööjärjekord, töövoog

Mate-pair ja paired end tüüpi paarislugemite vahe tegemiseks ei ole me leidnud sobivat terminit. Paljud arvasid, et seda erinevust pole eriti tihti vaja rõhutada kuna mate-pair’i kasutatakse harva. Seega jääb hetkel vastutus kirjutajale, et tuua täiendava tekstina välja, kas antud juhul kasutati paired-end tüüpi paarislugemeid või mate-pair tüüpi paarislugemeid.