ANDMEANAL††S MOLEKULAARBIOLOOGIAS

LOMR.10.007

Vastutav lŠbiviija: Maido Remm

2017

Tšškorraldus:

Hinne kujuneb 100% eksamil saadud punktidest.

 

Loengud:

Loengud toimuvad esmaspŠeviti kell 12 Riia 23 auditooriumis 217.

 

Praktikumid:

Iga nŠdal (vŠlja arvatud kolmas nŠdal) toimub kaks sama sisuga praktikumi, kus harjutatakse praktilisi oskusi tabelarvutusprogrammide ning veebis asuvate programmidega.

Kes soovib, v›ib kŠia oskuste kinnistamiseks ning tŠiendavate kŸsimuste kŸsimiseks m›lemas praktikumis.

Peamiseks tarkvaraks on Excel v›i LibreOffice.

 

Eksamid:

Eksamil on nii teoreetilised kŸsimused kui praktilised Ÿlesanded, vajalik arvuti olemasolu.

Eksamil vajalikud praktilised oskused (viimati uuendatud 16.01.2017).

 

HindamissŸsteem:

Eksami eest on v›imalik saada maksimaalselt 100 punkti.

Lisapunkte on v›imalik saada sisuliste kŸsimuste kŸsimise eest loengus (maksimaalselt 1 punkt inimese kohta igas loengus).

Hindamine toimub punktide alusel:

0-50 = F

51-60 = E

61-70 = D

71-80 = C

81-90 = B

91-100 = A

 

Ajakava ja loengute teemad:

1. nŠdal (6.02 Š 8.02)

Statistika vajalikkusest

Andmete hajuvuse kirjeldamine

Histogramm ja karpdiagramm

KeskvŠŠrtus, mood, mediaan, kvantiilid, kvartiilid, protsentiilid

Loengu fail

Praktikumi slaidid

Praktikumi andmed

 

Teema m›istmisel on abiks kui loete jŠrgnevaid materjale:

PeatŸkk 1: ćStatistics and Probability Are Not IntuitiveŅ

PeatŸkk 2: ćWhy Statistics Can Be Hard to LearnŅ

PeatŸkk 7: ćGraphing Continuous DataŅ

PeatŸkk 8: "Types of Variables"

PeatŸkk 9: "Quantifying Scatter"

 

2. nŠdal (13.02-15.02)

Usaldusintervallide kasutamine keskvŠŠrtuse hindamisel (pidev tunnus)

Usaldusintervallide kasutamine keskvŠŠrtuse hindamisel (binaarne tunnus)

Loengu fail

Praktikumi slaidid

Praktikumi andmed

 

Teema m›istmisel on abiks kui loete:

PeatŸkk 10: ćThe Gaussian DistributionŅ

PeatŸkk 12: "Confidence Interval of a Mean"

PeatŸkk   4: ŅConfidence Interval of a ProportionÓ

PeatŸkk 13: "The Theory of Confidence Intervals"

PeatŸkk 14: "Error Bars"

 

3. nŠdal (20.02-20.02) Praktikumi ei toimu, ainult loeng

HŸpoteeside testimise Ÿldised p›him›tted

P-vŠŠrtuse m›iste ja efekti suuruse m›iste

Loengu fail

 

Teema m›istmisel on abiks kui loete:

PeatŸkk 15: ćIntroducing P-ValuesŅ

PeatŸkk 16: ćStatistical Significance and Hypothesis TestingŅ

 

4. nŠdal (27.02 Š 1.03)

Kahe katse keskvŠŠrtuste erinevuse testimine (t-test)

Proportsioonide erinevuse testimine (hiiruut-test ja Fisheri tŠpne test)

Loengu fail

Praktikumi slaidid

Praktikumi andmed

 

Teema m›istmisel on abiks kui loete:

PeatŸkk 26: "Comparing Observed and Expected Distributions"

PeatŸkk 27: "Comparing Proportions: Prospective and Experimental Studies"

PeatŸkk 28: "Comparing Proportions: Case-Control Studies"

PeatŸkk 30: "Comparing Two Means: Unpaired t Test"

PeatŸkk 31: "Comparing Two Paired Groups"

 

5. nŠdal (6.03 Š 8.03)

Korrelatsioon ja regressioon

Mitmene regressioon ja statistiline modelleerimine

Loengu fail

Praktikumi slaidid

Praktikumi andmed

 

Teema m›istmisel on abiks kui loete:

PeatŸkk 32: ćCorrelationŅ

PeatŸkk 33: ćSimple Linear RegressionŅ

PeatŸkk 34: ćIntroducing ModelsŅ

 

6. nŠdal (13.03 Š 15.03)

E Proovieksam 12-14, ruumis 217

T ja K kell 12-14 Riia 23-218

Toimub lisapraktikum proovieksami kŸsimuste Ÿle vaatamiseks olemasolevate oskuste treenimiseks ja harjutamiseks. Uut materjali juurde ei v›eta, m›elge omalt poolt vŠlja kŸsimused ja teemad, mida soovite harjutada.

 

7. nŠdal (20.03)

I Eksam: 20.03 14.15-16.00, ruumis 105

 

8. nŠdal (28.03)

II Eksam: 28.03 12.15-14.00, ruumis 105

 

†ks korduseksam aprillikuus

NB!

Korduseksamile v›tan ainult lŠbikukkunud v›i eksamile mitteilmunud Ÿli›pilasi.

Ķppekorralduseeskiri lubab korduseksamit sooritada vaid 1 kord semestri jooksul. Seega valige korduseksamiks aeg mis teile hŠsti sobib ja valmistuge eksamiks korralikult.

 

 

Ķppematerjalid:

 

Peamine ›ppematerjal on raamat:

Motulsky: Intuitive Biostatistics: A Nonmathematical Guide to Statistical Thinking (2009)

Kellel pole v›imalik isiklikku ›ppematerjali soetada saab lugeda skaneeritud versiooni:

http://bioinfo.ut.ee/AMB/AMB_LOMR.10.007/

Kataloogi saab nŠha kasutaja ja salas›naga:

(kursus:amb2013)

 

OpenOffice ja LibreOffice kasutajatele:

Statistika funktsioonide pakett OOoStat Help

 

Lingid on-line tššriistadele

Proportsioonide (protsentide) usalduspiiride arvutamine:

http://www.graphpad.com/quickcalcs/confInterval1/

 

Fisheri tŠpne test:

http://www.langsrud.com/fisher.htm

http://www.graphpad.com/quickcalcs/contingency1.cfm

http://www.quantitativeskills.com/sisa/statistics/fisher.htm

 

Spearmani astak-korrelatsiooni test:

http://www.wessa.net/rankcorr.wasp

 

Korrelatsioonikordaja olulisuse testimine:

http://www.graphpad.com/quickcalcs/PValue1.cfm

 

 

Veel kasulikku lugemist:

Raamat Andres Kiviste: Matemaatiline Statistika MS Exceli keskkonnas (2007)

Raamat Ene-Margit Tiit, MŠrt Mšls: Rakendusstatistika lŸhikursus (1997)

Sarnane loengukursus školoogidele: Toomas Tammaru, Katseandmete analŸŸs

 

Raamat Bremer and Doerge: Statistics at the Bench. A Step-by-Step Handbook for Biologists (2010)

Raamat Neil J. Salkind: Statistics for People Who Think They Hate Statistics: The Excel 2007 Edition (2009)

Veebis on hea lihtne ›pik algajatele lehekŸljel onlinestatbook.com